Durante el tratamiento con quimioterapia o con Imatinib es necesario realizar de forma frecuente análisis de sangre, para valorar en estado de las células de la sangre que pueden disminuir demasiado, debido al tratamiento.

También es necesario controlar el estado de la función hepática y renal.

Periódicamente es necesario realizar nuevos estudios de médula ósea y, ocasionalmente, repetir los estudios citogenéticos. Actualmente existen criterios de estandarización de respuesta al tratamiento de esta enfermedad que permite unificar y  conservar los tratamientos en los distintos centros