Como se ha dicho antes la presencia de metástasis es excepcional (del 1 al 5%). En el 5 al 10% de los pacientes puede existir afectación de los ganglios linfáticos. Esto, en cambio es mucho más raro en el Carcinoma de células basales.
Las características histológicas asociadas a un mayor riesgo de recaída de la enfermedad son: tamaño grande de la lesión, invasión perineural e infiltración del tejido subcutáneo. La localización en la cara, orejas y cuero cabelludo tienen un peor pronóstico.
Cuando el tratamiento es el adecuado las tasas de curación son superiores al 90%.
Globalmente la tasa de recurrencia es del 8% en los 5 primeros años.
Hay que tener en cuenta que estos pacientes sí tienen un riesgo aumentado de desarrollar nuevos tumores en la piel, en otras localizaciones, por lo que es muy importante el examen dermatológico regular.